0.3 安装必要的软件

与在Docker中使用不同,另一种选择是直接在主机操作系统上安装依赖项。为此,我们概括了一个工具栈,可以作为示例的基础。您必须安装以下组件:

  1. CMake

  2. 编译器

  3. 自动化构建工具

  4. Python

我们还会详细介绍,如何安装所需的某些依赖项。

0.3.1 获取CMake

本书要使用的CMake最低需要为3.5。只有少数示例,演示了3.5版之后引入的新功能。每个示例都有提示,指出示例代码在哪里可用,以及所需的CMake的最低版本。提示信息如下:

NOTE:这个示例的代码可以在 https://github.com/dev-cafe/cmake-cookbook/tree/v1.0/chapter-03/recipe10 中找到,其中包括一个C示例。该示例在CMake 3.5版(或更高版本)中是有效的,并且已经在GNU/Linux、macOS和Windows上进行了测试。

有些(如果不是大多数)示例仍然适用于较低版本的CMake。但是,我们没有测试过这个。我们认为CMake 3.5是大多数系统和发行版的默认软件,而且升级CMake也没什么难度。

CMake可以以多种方式安装。下载并提取由Kitware维护的二进制发行版,可以在所有平台上运行,下载页面位于 https://cmake.org/download/

大多数GNU/Linux发行版都在包管理器中提供了CMake。然而,在一些发行版中,版本可能比较旧,因此下载由Kitware提供的二进制文件当然是首选。下面的命令将从CMake打包的版本中下载并安装在$HOME/Deps/CMake(根据您的偏好调整此路径)下的CMake 3.5.2:

$ cmake_version="3.5.2"
$ target_path=$HOME/Deps/cmake/${cmake_version}
$ cmake_url="https://cmake.org/files/v${cmake_version%.*}/cmake-${cmake_version}-Linux-x86_64.tar.gz"
$ mkdir -p "${target_path}"
$ curl -Ls "${cmake_url}" | tar -xz -C "${target_path}" --strip-components=1
$ export PATH=$HOME/Deps/cmake/${cmake_version}/bin${PATH:+:$PATH}
$ cmake --version

macOS获取最新版本的CMake:

$ brew upgrade cmake

Windows上,可以使用Visual Studio 2017,它提供了CMake支持。Visual Studio 2017的安装记录在第13章,可选生成器和交叉编译,示例技巧1,使用Visual Studio 2017构建CMake项目

或者,可以从 https://www.msys2.org 下载MSYS2安装程序,按照其中给出的说明更新包列表,然后使用包管理器pacman安装CMake。下面的代码正在构建64位版本:

$ pacman -S mingw64/mingw-w64-x86_64-cmake

对于32位版本,请使用以下代码(为了简单起见,我们以后只会提到64位版本):

$ pacman -S mingw64/mingw-w64-i686-cmake

MSYS2的另一个特性是在Windows上提供了一个终端,比较像Unix操作系统上的终端,提供可用的开发环境。

0.3.2 编译器

我们将需要C++、C和Fortran的编译器。编译器的版本需要比较新,因为我们需要在大多数示例中支持最新的语言标准。CMake为来自商业和非商业供应商的许多编译器,提供了非常好的支持。为了让示例始终能够跨平台,并尽可能独立于操作系统,我们使用了开源编译器:

  • GNU/Linux上,GNU编译器集合(GCC)是直接的选择。它是免费的,适用于所有发行版。例如,在Ubuntu上,可以安装以下编译器:

    $ sudo apt-get install g++ gcc gfortran
  • 在LLVM家族中,Clang也是C++和C编译器的一个很好的选择:

    $ sudo apt-get install clang clang++ gfortran
  • macOS上,XCode附带的LLVM编译器适用于C++和C。我们在macOS测试中使用了GCC的Fortran编译器。GCC编译器必须使用包管理器单独安装:

    $ brew install gcc
  • Windows上,可以使用Visual Studio测试C++和C示例。或者,可以使用MSYS2安装程序,MSYS2环境中(对于64位版本)使用以下单个命令安装整个工具链,包括C++、C和Fortran编译器:

    $ pacman -S mingw64/mingw-w64-x86_64-toolchain

0.3.3 自动化构建工具

自动化构建工具为示例中的项目提供构建和链接的基础设施,最终会安装和使用什么,很大程度上取决于操作系统:

  • GNU/Linux上,GNU Make(很可能)在安装编译器时自动安装。

  • macOS上,XCode将提供GNU Make。

  • Windows上,Visual Studio提供了完整的基础设施。MSYS2环境中,GNU Make作为mingw64/mingw-w64-x86_64工具链包的一部分,进行安装。

为了获得最大的可移植性,我们尽可能使示例不受这些系统相关细节的影响。这种方法的优点是配置、构建和链接,是每个编译器的固有特性

Ninja是一个不错的自动化构建工具,适用于GNU/Linux、macOS和Windows。Ninja注重速度,特别是增量重构。为GNU/Linux、macOS和Windows预先打包的二进制文件可以在GitHub库中找到,网址是 https://github.com/ninja-build/ninja/releases

Fortran项目中使用CMake和Ninja需要注意。使用CMake 3.7.2或更高版本是必要的,Kitware还有维护Ninja,相关包可以在 https://github.com/Kitware/ninja/releases 上找到。

在GNU/Linux上,可以使用以下一系列命令安装Ninja:

$ mkdir -p ninja
$ ninja_url="https://github.com/Kitware/ninja/releases/download/v1.8.2.g3bbbe.kitware.dyndep-1.jobserver-1/ninja-1.8.2.g3bbbe.kitware.dyndep-1.jobserver-1_x86_64-linux-gnu.tar.gz"
$ curl -Ls ${ninja_url} | tar -xz -C ninja --strip-components=1
$ export PATH=$HOME/Deps/ninja${PATH:+:$PATH}

Windows上,使用MSYS2环境(假设是64位版本)执行以下命令:

$ pacman -S mingw64/mingw-w64-x86_64-ninja

NOTE:我们建议阅读这篇文章 http://www.aosabook.org/en/posa/ninja.html ,里面是对NInja编译器的历史和设计的选择,进行启发性的讨论。

0.3.4 Python

本书主要关于CMake,但是其中的一些方法,需要使用Python。因此,也需要对Python进行安装:解释器、头文件和库。Python 2.7的生命周期结束于2020年,因此我们将使用Python 3.5。

在Ubuntu 14.04 LTS上(这是Travis CI使用的环境,我们后面会讨论),Python 3.5可以安装如下:

sudo apt-get install python3.5-dev

Windows可使用MSYS2环境,Python安装方法如下(假设是64位版本):

$ pacman -S mingw64/mingw-w64-x86_64-python3
$ pacman -S mingw64/mingw-w64-x86_64-python3-pip
$ python3 -m pip install pipenv

为了运行已经写好的测试机制,还需要一些特定的Python模块。可以使用包管理器在系统范围内安装这些包,也可以在隔离的环境中安装。建议采用后一种方法:

  • 可以在不影响系统环境的情况下,将安装包进行清理/安装。

  • 可以在没有管理员权限的情况下安装包。

  • 可以降低软件版本和依赖项冲突的风险。

  • 为了复现性,可以更好地控制包的依赖性。

为此,我们准备了一个Pipfile。结合pipfile.lock,可以使用Pipenv( http://pipenv.readthedocs )。创建一个独立的环境,并安装所有包。要为示例库创建此环境,可在库的顶层目录中运行以下命令:

$ pip install --user pip pipenv --upgrade
$ pipenv install --python python3.5

执行pipenv shell命令会进入一个命令行环境,其中包含特定版本的Python和可用的包。执行exit将退出当前环境。当然,还可以使用pipenv run在隔离的环境中直接执行命令。

或者,可以将库中的requirements.txt文件与Virtualenv( http://docs.pythonguide.org/en/latest/dev/virtualenvs/ )和pip结合使用,以达到相同的效果:

$ virtualenv --python=python3.5 venv
$ source venv/bin/activate
$ pip install -r requirements.txt

可以使用deactivate命令退出虚拟环境。

另一种选择是使用Conda环境,我们建议安装Miniconda。将把最新的Miniconda安装到GNU/Linux的$HOME/Deps/conda目录(从 https://repo.continuum.io/miniconda/miniconda3-latestlinux-x86_64.sh 下载)或macOS(从 https://repo.continuum.io/miniconda/miniconda3-latestmacosx-x86_64.sh 下载):

$ curl -Ls https://repo.continuum.io/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh > miniconda.sh
$ bash miniconda.sh -b -p "$HOME"/Deps/conda &> /dev/null
$ touch "$HOME"/Deps/conda/conda-meta/pinned
$ export PATH=$HOME/Deps/conda/bin${PATH:+:$PATH}
$ conda config --set show_channel_urls True
$ conda config --set changeps1 no
$ conda update --all
$ conda clean -tipy

Windows上,可以从 https://repo.continuum.io/miniconda/Miniconda3-latest-Windows-x86_64.exe 下载最新的Miniconda。该软件包可以使用PowerShell安装,如下:

$basedir = $pwd.Path + "\"
$filepath = $basedir + "Miniconda3-latest-Windows-x86_64.exe"
$Anaconda_loc = "C:\Deps\conda"
$args = "/InstallationType=JustMe /AddToPath=0 /RegisterPython=0 /S /D=$Anaconda_loc"
Start-Process -FilePath $filepath -ArgumentList $args -Wait -Passthru
$conda_path = $Anaconda_loc + "\Scripts\conda.exe"
$args = "config --set show_channel_urls True"
Start-Process -FilePath "$conda_path" -ArgumentList $args -Wait -Passthru
$args = "config --set changeps1 no"
Start-Process -FilePath "$conda_path" -ArgumentList $args -Wait -Passthru
$args = "update --all"
Start-Process -FilePath "$conda_path" -ArgumentList $args -Wait -Passthru
$args = "clean -tipy"
Start-Process -FilePath "$conda_path" -ArgumentList $args -Wait -Passthru

安装了Conda后, Python模块可以按如下方式安装:

$ conda create -n cmake-cookbook python=3.5
$ conda activate cmake-cookbook
$ conda install --file requirements.txt

执行conda deactivate将退出conda的环境。

0.3.5 依赖软件

有些示例需要额外的依赖,这些软件将在这里介绍。

0.3.5.1 BLAS和LAPACK

大多数Linux发行版都为BLAS和LAPACK提供包。例如,在Ubuntu 14.04 LTS上,您可以运行以下命令:

$ sudo apt-get install libatlas-dev liblapack-dev liblapacke-dev

macOS上,XCode附带的加速库可以满足我们的需要。

Windows使用MSYS2环境,可以按如下方式安装这些库(假设是64位版本):

$ pacman -S mingw64/mingw-w64-x86_64-openblas

或者,可以从GitHub ( https://github.com/referlapack/lapack )下载BLAS和LAPACK的参考实现,并从源代码编译库。商业供应商为平台提供安装程序,安装包中有BLAS和LAPACK相关的API。

0.3.5.2 消息传递接口(MPI)

MPI有许多商业和非商业实现。这里,安装免费的非商业实现就足够了。在Ubuntu 14.04 LTS上,我们推荐OpenMPI。可使用以下命令安装:

$ sudo apt-get install openmpi-bin libopenmpi-dev

在macOS上,Homebrew发布了MPICH

$ brew install mpich

还可以从 https://www.open-mpi.org/software/ 上获取源代码,编译OpenMPI。 对于Windows,Microsoft MPI可以通过 https://msdn.microsoft.com/en-us/library/bb524831(v=vs.85).aspx 下载安装。

0.3.5.3 线性代数模板库

一些示例需要线性代数模板库,版本为3.3或更高。如果包管理器不提供Eigen,可以使用在线打包源(http://eigen.tuxfamily.org )安装它。例如,在GNU/Linux和macOS上,可以将Eigen安装到$HOME/Deps/Eigen目录:

$ eigen_version="3.3.4"
$ mkdir -p eigen
$ curl -Ls http://bitbucket.org/eigen/eigen/get/${eigen_version}.tar.gz | tar -xz -C eigen --strip-components=1
$ cd eigen
$ cmake -H. -Bbuild_eigen -
DCMAKE_INSTALL_PREFIX="$HOME/Deps/eigen" &> /dev/null
$ cmake --build build_eigen -- install &> /dev/null

0.3.5.4 Boost库

Boost库适用于各种操作系统,大多数Linux发行版都通过它们的包管理器提供该库的安装。例如,在Ubuntu 14.04 LTS上,Boost文件系统库、Boost Python库和Boost测试库可以通过以下命令安装:

$ sudo apt-get install libboost-filesystem-dev libboost-python-dev libboost-test-dev

对于macOS, MacPorts和自制程序都为最新版本的Boost提供了安装包。我们在macOS上的测试设置安装Boost如下:

$ brew cask uninstall --force oclint
$ brew uninstall --force --ignore-dependencies boost
$ brew install boost
$ brew install boost-python3

Windows的二进制发行版也可以从Boost网站 http://www.boost.org 下载。或者,可以从 https://www.boost.org 下载源代码,并自己编译Boost库。

0.3.5.5 交叉编译器

在类Debian/Ubuntu系统上,可以使用以下命令安装交叉编译器:

$ sudo apt-get install gcc-mingw-w64 g++-mingw-w64 gfortran-mingw-w64

在macOS上,使用Brew,可以安装以下交叉编译器:

$ brew install mingw-w64

其他包管理器提供相应的包。使用打包的跨编译器的另一种方法,是使用M交叉环境( https://mxe.cc ),并从源代码对其进行构建。

0.3.5.6 ZeroMQ, pkg-config, UUID和Doxygen

Ubuntu 14.04 LTS上,这些包可以安装如下:

$ sudo apt-get install pkg-config libzmq3-dev doxygen graphviz-dev uuid-dev

macOS上,我们建议使用Brew安装:

$ brew install ossp-uuid pkg-config zeromq doxygen

pkg-config程序和UUID库只在类Unix系统上可用。 Windows上使用MSYS2环境,可以按如下方式安装这些依赖项(假设是64位版本):

$ pacman -S mingw64/mingw-w64-x86_64-zeromq
$ pacman -S mingw64/mingw-w64-x86_64-pkg-config
$ pacman -S mingw64/mingw-w64-x86_64-doxygen
$ pacman -S mingw64/mingw-w64-x86_64-graphviz

0.3.5.7 Conda的构建和部署

想要使用Conda打包的示例的话,需要MinicondaConda构建和部署工具。Miniconda的安装说明之前已经给出。要在GNU/Linux和macOS上安装Conda构建和部署工具,请运行以下命令:

$ conda install --yes --quiet conda-build anaconda-client jinja2 setuptools
$ conda clean -tipsy
$ conda info -a

这些工具也可以安装在Windows上:

$conda_path = "C:\Deps\conda\Scripts\conda.exe"
$args = "install --yes --quiet conda-build anaconda-client jinja2 setuptools"
Start-Process -FilePath "$conda_path" -ArgumentList $args -Wait -Passthru
$args = "clean -tipsy"
Start-Process -FilePath "$conda_path" -ArgumentList $args -Wait -Passthru
$args = "info -a"
Start-Process -FilePath "$conda_path" -ArgumentList $args -Wait -Passthru

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