📘
CMake Cookbook
  • Introduction
  • 前言
  • 第0章 配置环境
    • 0.1 获取代码
    • 0.2 Docker镜像
    • 0.3 安装必要的软件
    • 0.4 测试环境
    • 0.5 上报问题并提出改进建议
  • 第1章 从可执行文件到库
    • 1.1 将单个源文件编译为可执行文件
    • 1.2 切换生成器
    • 1.3 构建和链接静态库和动态库
    • 1.4 用条件句控制编译
    • 1.5 向用户显示选项
    • 1.6 指定编译器
    • 1.7 切换构建类型
    • 1.8 设置编译器选项
    • 1.9 为语言设定标准
    • 1.10 使用控制流
  • 第2章 检测环境
    • 2.1 检测操作系统
    • 2.2 处理与平台相关的源代码
    • 2.3 处理与编译器相关的源代码
    • 2.4 检测处理器体系结构
    • 2.5 检测处理器指令集
    • 2.6 为Eigen库使能向量化
  • 第3章 检测外部库和程序
    • 3.1 检测Python解释器
    • 3.2 检测Python库
    • 3.3 检测Python模块和包
    • 3.4 检测BLAS和LAPACK数学库
    • 3.5 检测OpenMP的并行环境
    • 3.6 检测MPI的并行环境
    • 3.7 检测Eigen库
    • 3.8 检测Boost库
    • 3.9 检测外部库:Ⅰ. 使用pkg-config
    • 3.10 检测外部库:Ⅱ. 自定义find模块
  • 第4章 创建和运行测试
    • 4.1 创建一个简单的单元测试
    • 4.2 使用Catch2库进行单元测试
    • 4.3 使用Google Test库进行单元测试
    • 4.4 使用Boost Test进行单元测试
    • 4.5 使用动态分析来检测内存缺陷
    • 4.6 预期测试失败
    • 4.7 使用超时测试运行时间过长的测试
    • 4.8 并行测试
    • 4.9 运行测试子集
    • 4.10 使用测试固件
  • 第5章 配置时和构建时的操作
    • 5.1 使用平台无关的文件操作
    • 5.2 配置时运行自定义命令
    • 5.3 构建时运行自定义命令:Ⅰ. 使用add_custom_command
    • 5.4 构建时运行自定义命令:Ⅱ. 使用add_custom_target
    • 5.5 构建时为特定目标运行自定义命令
    • 5.6 探究编译和链接命令
    • 5.7 探究编译器标志命令
    • 5.8 探究可执行命令
    • 5.9 使用生成器表达式微调配置和编译
  • 第6章 生成源码
    • 6.1 配置时生成源码
    • 6.2 使用Python在配置时生成源码
    • 6.3 构建时使用Python生成源码
    • 6.4 记录项目版本信息以便报告
    • 6.5 从文件中记录项目版本
    • 6.6 配置时记录Git Hash值
    • 6.7 构建时记录Git Hash值
  • 第7章 构建项目
    • 7.1 使用函数和宏重用代码
    • 7.2 将CMake源代码分成模块
    • 7.3 编写函数来测试和设置编译器标志
    • 7.4 用指定参数定义函数或宏
    • 7.5 重新定义函数和宏
    • 7.6 使用废弃函数、宏和变量
    • 7.7 add_subdirectory的限定范围
    • 7.8 使用target_sources避免全局变量
    • 7.9 组织Fortran项目
  • 第8章 超级构建模式
    • 8.1 使用超级构建模式
    • 8.2 使用超级构建管理依赖项:Ⅰ.Boost库
    • 8.3 使用超级构建管理依赖项:Ⅱ.FFTW库
    • 8.4 使用超级构建管理依赖项:Ⅲ.Google Test框架
    • 8.5 使用超级构建支持项目
  • 第9章 语言混合项目
    • 9.1 使用C/C++库构建Fortran项目
    • 9.2 使用Fortran库构建C/C++项目
    • 9.3 使用Cython构建C++和Python项目
    • 9.4 使用Boost.Python构建C++和Python项目
    • 9.5 使用pybind11构建C++和Python项目
    • 9.6 使用Python CFFI混合C,C++,Fortran和Python
  • 第10章 编写安装程序
    • 10.1 安装项目
    • 10.2 生成输出头文件
    • 10.3 输出目标
    • 10.4 安装超级构建
  • 第11章 打包项目
    • 11.1 生成源代码和二进制包
    • 11.2 通过PyPI发布使用CMake/pybind11构建的C++/Python项目
    • 11.3 通过PyPI发布使用CMake/CFFI构建C/Fortran/Python项目
    • 11.4 以Conda包的形式发布一个简单的项目
    • 11.5 将Conda包作为依赖项发布给项目
  • 第12章 构建文档
    • 12.1 使用Doxygen构建文档
    • 12.2 使用Sphinx构建文档
    • 12.3 结合Doxygen和Sphinx
  • 第13章 选择生成器和交叉编译
    • 13.1 使用CMake构建Visual Studio 2017项目
    • 13.2 交叉编译hello world示例
    • 13.3 使用OpenMP并行化交叉编译Windows二进制文件
  • 第14章 测试面板
    • 14.1 将测试部署到CDash
    • 14.2 CDash显示测试覆盖率
    • 14.3 使用AddressSanifier向CDash报告内存缺陷
    • 14.4 使用ThreadSaniiser向CDash报告数据争用
  • 第15章 使用CMake构建已有项目
    • 15.1 如何开始迁移项目
    • 15.2 生成文件并编写平台检查
    • 15.3 检测所需的链接和依赖关系
    • 15.4 复制编译标志
    • 15.5 移植测试
    • 15.6 移植安装目标
    • 15.7 进一步迁移的措施
    • 15.8 项目转换为CMake的常见问题
  • 第16章 可能感兴趣的书
    • 16.1 留下评论——让其他读者知道你的想法
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  • 准备工作
  • 具体实施
  • 工作原理

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  1. 第3章 检测外部库和程序

3.3 检测Python模块和包

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Last updated 5 years ago

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NOTE:此示例代码可以在 中找到,包含一个C++示例。该示例在CMake 3.5版(或更高版本)中是有效的,并且已经在GNU/Linux、macOS和Windows上进行过测试。

前面的示例中,我们演示了如何检测Python解释器,以及如何编译一个简单的C程序(嵌入Python解释器)。通常,代码将依赖于特定的Python模块,无论是Python工具、嵌入Python的程序,还是扩展Python的库。例如,科学界非常流行使用NumPy处理矩阵问题。依赖于Python模块或包的项目中,确定满足对这些Python模块的依赖非常重要。本示例将展示如何探测用户的环境,以找到特定的Python模块和包。

准备工作

我们将尝试在C++程序中嵌入一个稍微复杂一点的例子。这个示例再次引用,并展示了如何通过调用编译后的C++可执行文件,来执行用户定义的Python模块中的函数。

Python 3示例代码(Py3-pure-embedding.cpp)包含以下源代码(请参见 与Python 2代码等效):

#include <Python.h>
int main(int argc, char* argv[]) {
  PyObject* pName, * pModule, * pDict, * pFunc;
  PyObject* pArgs, * pValue;
  int i;
  if (argc < 3) {
    fprintf(stderr, "Usage: pure-embedding pythonfile funcname [args]\n");
    return 1;
  }
  Py_Initialize();
  PyRun_SimpleString("import sys");
  PyRun_SimpleString("sys.path.append(\".\")");
  pName = PyUnicode_DecodeFSDefault(argv[1]);
  /* Error checking of pName left out */
  pModule = PyImport_Import(pName);
  Py_DECREF(pName);
  if (pModule != NULL) {
    pFunc = PyObject_GetAttrString(pModule, argv[2]);
    /* pFunc is a new reference */
    if (pFunc && PyCallable_Check(pFunc)) {
      pArgs = PyTuple_New(argc - 3);
      for (i = 0; i < argc - 3; ++i) {
        pValue = PyLong_FromLong(atoi(argv[i + 3]));
        if (!pValue) {
          Py_DECREF(pArgs);
          Py_DECREF(pModule);
          fprintf(stderr, "Cannot convert argument\n");
          return 1;
        }
        /* pValue reference stolen here: */
        PyTuple_SetItem(pArgs, i, pValue);
      }
      pValue = PyObject_CallObject(pFunc, pArgs);
      Py_DECREF(pArgs);
      if (pValue != NULL) {
        printf("Result of call: %ld\n", PyLong_AsLong(pValue));
        Py_DECREF(pValue);
      }
      else {
        Py_DECREF(pFunc);
        Py_DECREF(pModule);
        PyErr_Print();
        fprintf(stderr, "Call failed\n");
        return 1;
      }
    }
    else {
      if (PyErr_Occurred())
        PyErr_Print();
      fprintf(stderr, "Cannot find function \"%s\"\n", argv[2]);
    }
    Py_XDECREF(pFunc);
    Py_DECREF(pModule);
  }
  else {
    PyErr_Print();
    fprintf(stderr, "Failed to load \"%s\"\n", argv[1]);
    return 1;
  }
  Py_Finalize();
  return 0;
}

我们希望嵌入的Python代码(use_numpy.py)使用NumPy设置一个矩阵,所有矩阵元素都为1.0:

import numpy as np
def print_ones(rows, cols):
  A = np.ones(shape=(rows, cols), dtype=float)
  print(A)

  # we return the number of elements to verify
  # that the C++ code is able to receive return values
  num_elements = rows*cols
  return(num_elements)

具体实施

下面的代码中,我们能够使用CMake检查NumPy是否可用。我们需要确保Python解释器、头文件和库在系统上是可用的。然后,将再来确认NumPy的可用性:

  1. 首先,我们定义了最低CMake版本、项目名称、语言和C++标准:

    cmake_minimum_required(VERSION 3.5 FATAL_ERROR)
    project(recipe-03 LANGUAGES CXX)
    set(CMAKE_CXX_STANDARD 11)
    set(CMAKE_CXX_EXTENSIONS OFF)
    set(CMAKE_CXX_STANDARD_REQUIRED ON)
  2. 查找解释器、头文件和库的方法与前面的方法完全相同:

    find_package(PythonInterp REQUIRED)
    find_package(PythonLibs ${PYTHON_VERSION_MAJOR}.${PYTHON_VERSION_MINOR} EXACT REQUIRED)
  3. 正确打包的Python模块,指定安装位置和版本。可以在CMakeLists.txt中执行Python脚本进行探测:

    execute_process(
      COMMAND
          ${PYTHON_EXECUTABLE} "-c" "import re, numpy; print(re.compile('/__init__.py.*').sub('',numpy.__file__))"
      RESULT_VARIABLE _numpy_status
      OUTPUT_VARIABLE _numpy_location
      ERROR_QUIET
      OUTPUT_STRIP_TRAILING_WHITESPACE
      )
  4. 如果找到NumPy,则_numpy_status变量为整数,否则为错误的字符串,而_numpy_location将包含NumPy模块的路径。如果找到NumPy,则将它的位置保存到一个名为NumPy的新变量中。注意,新变量被缓存,这意味着CMake创建了一个持久性变量,用户稍后可以修改该变量:

    if(NOT _numpy_status)
        set(NumPy ${_numpy_location} CACHE STRING "Location of NumPy")
    endif()
  5. 下一步是检查模块的版本。同样,我们在CMakeLists.txt中施加了一些Python魔法,将版本保存到_numpy_version变量中:

    execute_process(
      COMMAND
          ${PYTHON_EXECUTABLE} "-c" "import numpy; print(numpy.__version__)"
      OUTPUT_VARIABLE _numpy_version
      ERROR_QUIET
      OUTPUT_STRIP_TRAILING_WHITESPACE
      )
  6. 最后,FindPackageHandleStandardArgs的CMake包以正确的格式设置NumPy_FOUND变量和输出信息:

    include(FindPackageHandleStandardArgs)
    find_package_handle_standard_args(NumPy
      FOUND_VAR NumPy_FOUND
      REQUIRED_VARS NumPy
      VERSION_VAR _numpy_version
      )
  7. 一旦正确的找到所有依赖项,我们就可以编译可执行文件,并将其链接到Python库:

    add_executable(pure-embedding "")
    
    target_sources(pure-embedding
      PRIVATE
          Py${PYTHON_VERSION_MAJOR}-pure-embedding.cpp
      )
    
    target_include_directories(pure-embedding
      PRIVATE
          ${PYTHON_INCLUDE_DIRS}
      )
    
    target_link_libraries(pure-embedding
      PRIVATE
          ${PYTHON_LIBRARIES}
      )
  8. 我们还必须保证use_numpy.py在build目录中可用:

    add_custom_command(
      OUTPUT
          ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/use_numpy.py
      COMMAND
          ${CMAKE_COMMAND} -E copy_if_different ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/use_numpy.py
          ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/use_numpy.py
      DEPENDS
          ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/use_numpy.py
      )
    
    # make sure building pure-embedding triggers the above custom command
    target_sources(pure-embedding
      PRIVATE
          ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/use_numpy.py
      )
  9. 现在,我们可以测试嵌入的代码:

    $ mkdir -p build
    $ cd build
    $ cmake ..
    
    -- ...
    -- Found PythonInterp: /usr/bin/python (found version "3.6.5")
    -- Found PythonLibs: /usr/lib/libpython3.6m.so (found suitable exact version "3.6.5")
    -- Found NumPy: /usr/lib/python3.6/site-packages/numpy (found version "1.14.3")
    
    $ cmake --build .
    $ ./pure-embedding use_numpy print_ones 2 3
    
    [[1. 1. 1.]
    [1. 1. 1.]]
    Result of call: 6

工作原理

例子中有三个新的CMake命令,需要include(FindPackageHandleStandardArgs):

  • execute_process

  • add_custom_command

  • find_package_handle_standard_args

execute_process将作为通过子进程执行一个或多个命令。最后,子进程返回值将保存到变量作为参数,传递给RESULT_VARIABLE,而管道标准输出和标准错误的内容将被保存到变量作为参数传递给OUTPUT_VARIABLE和ERROR_VARIABLE。execute_process可以执行任何操作,并使用它们的结果来推断系统配置。本例中,用它来确保NumPy可用,然后获得模块版本。

find_package_handle_standard_args提供了,用于处理与查找相关程序和库的标准工具。引用此命令时,可以正确的处理与版本相关的选项(REQUIRED和EXACT),而无需更多的CMake代码。稍后将介绍QUIET和COMPONENTS选项。本示例中,使用了以下方法:

include(FindPackageHandleStandardArgs)
find_package_handle_standard_args(NumPy
  FOUND_VAR NumPy_FOUND
  REQUIRED_VARS NumPy
  VERSION_VAR _numpy_version
  )

所有必需的变量都设置为有效的文件路径(NumPy)后,发送到模块(NumPy_FOUND)。它还将版本保存在可传递的版本变量(_numpy_version)中并打印:

-- Found NumPy: /usr/lib/python3.6/site-packages/numpy (found version "1.14.3")

目前的示例中,没有进一步使用这些变量。如果返回NumPy_FOUND为FALSE,则停止配置。

最后,将use_numpy.py复制到build目录,对代码进行注释:

add_custom_command(
  OUTPUT
      ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/use_numpy.py
  COMMAND
      ${CMAKE_COMMAND} -E copy_if_different ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/use_numpy.py
      ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/use_numpy.py
  DEPENDS
      ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/use_numpy.py
  )

target_sources(pure-embedding
  PRIVATE
      ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/use_numpy.py
  )

我们也可以使用file(COPY…)命令来实现复制。这里,我们选择使用add_custom_command,来确保文件在每次更改时都会被复制,而不仅仅是第一次运行配置时。我们将在第5章更详细地讨论add_custom_command。还要注意target_sources命令,它将依赖项添加到${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/use_numpy.py;这样做是为了确保构建目标,能够触发之前的命令。

https://github.com/devcafe/cmake-cookbook/tree/v1.0/chapter-03/recipe-03
Python在线文档
https://docs.python.org/2/extending/embedding.html#pure-embedded